Hace mucho tiempo que no manejo plantillas de ruta y ya no recuerdo muy bien como funcionan, pero para cambiar la plantilla de una ruta ya creada yo probaría a ver qué pasa editando las correspondientes etiquetas en RouteProperties.xml. Pongo por ejemplo la de Bath-Templecombe:
<BlueprintID>
<iBlueprintLibrary-cAbsoluteBlueprintID>
<BlueprintSetID>
<iBlueprintLibrary-cBlueprintSetID>
<Provider d:type="cDeltaString">kuju</Provider>
<Product d:type="cDeltaString">railsimulator</Product>
</iBlueprintLibrary-cBlueprintSetID>
</BlueprintSetID>
<BlueprintID d:type="cDeltaString">TemplateRoutes\OxfoPadd.xml</BlueprintID>
</iBlueprintLibrary-cAbsoluteBlueprintID>
</BlueprintID>
¡Se ruega encarecidamente hacer una copia de seguridad de la ruta antes de editarla!